Protein–RNA interactions for Protein: A8MUA0

Putative UPF0607 protein ENSP00000381514, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUA0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A8MUA0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A8MUA0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A8MUA0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A8MUA0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A8MUA0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A8MUA0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A8MUA0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A8MUA0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
A8MUA0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A8MUA0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A8MUA0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A8MUA0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A8MUA0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A8MUA0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A8MUA0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
A8MUA0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A8MUA0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
A8MUA0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A8MUA0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A8MUA0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A8MUA0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A8MUA0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
A8MUA0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A8MUA0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A8MUA0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A8MUA0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A8MUA0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
A8MUA0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A8MUA0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A8MUA0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A8MUA0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A8MUA0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A8MUA0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A8MUA0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A8MUA0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
A8MUA0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A8MUA0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
A8MUA0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A8MUA0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A8MUA0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A8MUA0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
A8MUA0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
A8MUA0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MUA0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MUA0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MUA0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A8MUA0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A8MUA0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A8MUA0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
A8MUA0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A8MUA0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A8MUA0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A8MUA0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
A8MUA0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A8MUA0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A8MUA0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A8MUA0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
A8MUA0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A8MUA0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A8MUA0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
A8MUA0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A8MUA0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A8MUA0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
A8MUA0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
A8MUA0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
A8MUA0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A8MUA0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
A8MUA0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
A8MUA0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A8MUA0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A8MUA0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A8MUA0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A8MUA0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A8MUA0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
A8MUA0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A8MUA0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A8MUA0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A8MUA0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A8MUA0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
A8MUA0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
A8MUA0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A8MUA0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A8MUA0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A8MUA0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A8MUA0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
A8MUA0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
A8MUA0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
A8MUA0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A8MUA0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
A8MUA0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
A8MUA0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A8MUA0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
A8MUA0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A8MUA0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
A8MUA0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A8MUA0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A8MUA0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A8MUA0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A8MUA0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms