Protein–RNA interactions for Protein: A8K7I4

CLCA1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA1A8K7I4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCA1A8K7I4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCA1A8K7I4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCA1A8K7I4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCA1A8K7I4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCA1A8K7I4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms