Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF839A8K0R7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF839A8K0R7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNF839A8K0R7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF839A8K0R7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF839A8K0R7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms