Protein–RNA interactions for Protein: A6NM45

CLDN24, Putative claudin-24, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN24A6NM45 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLDN24A6NM45 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN24A6NM45 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN24A6NM45 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN24A6NM45 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN24A6NM45 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN24A6NM45 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms