Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPDYE4A6NLX3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SPDYE4A6NLX3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPDYE4A6NLX3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPDYE4A6NLX3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPDYE4A6NLX3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPDYE4A6NLX3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPDYE4A6NLX3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SPDYE4A6NLX3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPDYE4A6NLX3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SPDYE4A6NLX3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SPDYE4A6NLX3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SPDYE4A6NLX3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPDYE4A6NLX3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPDYE4A6NLX3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPDYE4A6NLX3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SPDYE4A6NLX3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPDYE4A6NLX3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SPDYE4A6NLX3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SPDYE4A6NLX3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SPDYE4A6NLX3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SPDYE4A6NLX3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPDYE4A6NLX3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPDYE4A6NLX3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SPDYE4A6NLX3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms