Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM200CA6NKL6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM200CA6NKL6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM200CA6NKL6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM200CA6NKL6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM200CA6NKL6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM200CA6NKL6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM200CA6NKL6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM200CA6NKL6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM200CA6NKL6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM200CA6NKL6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM200CA6NKL6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM200CA6NKL6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM200CA6NKL6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM200CA6NKL6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMEM200CA6NKL6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM200CA6NKL6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM200CA6NKL6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms