Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX2A6NKB5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCNX2A6NKB5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCNX2A6NKB5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX2A6NKB5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCNX2A6NKB5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX2A6NKB5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNX2A6NKB5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX2A6NKB5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNX2A6NKB5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNX2A6NKB5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNX2A6NKB5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNX2A6NKB5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNX2A6NKB5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNX2A6NKB5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNX2A6NKB5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNX2A6NKB5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNX2A6NKB5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNX2A6NKB5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX2A6NKB5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX2A6NKB5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX2A6NKB5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNX2A6NKB5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNX2A6NKB5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCNX2A6NKB5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX2A6NKB5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX2A6NKB5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX2A6NKB5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms