Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ZNF233A6NK53 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZNF233A6NK53 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZNF233A6NK53 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF233A6NK53 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF233A6NK53 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF233A6NK53 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZNF233A6NK53 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF233A6NK53 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZNF233A6NK53 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZNF233A6NK53 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF233A6NK53 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF233A6NK53 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZNF233A6NK53 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZNF233A6NK53 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
ZNF233A6NK53 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF233A6NK53 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF233A6NK53 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms