Protein–RNA interactions for Protein: A6NFX1

MFSD2B, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2BA6NFX1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MFSD2BA6NFX1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MFSD2BA6NFX1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MFSD2BA6NFX1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2BA6NFX1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2BA6NFX1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms