Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6BA6NDN3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6BA6NDN3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA6BA6NDN3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6BA6NDN3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA6BA6NDN3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GOLGA6BA6NDN3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6BA6NDN3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA6BA6NDN3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6BA6NDN3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6BA6NDN3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6BA6NDN3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GOLGA6BA6NDN3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GOLGA6BA6NDN3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA6BA6NDN3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA6BA6NDN3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms