Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZNF804BA4D1E1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF804BA4D1E1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF804BA4D1E1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF804BA4D1E1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF804BA4D1E1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF804BA4D1E1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF804BA4D1E1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF804BA4D1E1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNF804BA4D1E1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF804BA4D1E1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF804BA4D1E1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF804BA4D1E1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF804BA4D1E1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF804BA4D1E1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF804BA4D1E1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF804BA4D1E1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF804BA4D1E1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF804BA4D1E1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF804BA4D1E1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF804BA4D1E1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF804BA4D1E1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF804BA4D1E1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF804BA4D1E1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF804BA4D1E1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF804BA4D1E1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF804BA4D1E1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF804BA4D1E1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF804BA4D1E1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF804BA4D1E1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ZNF804BA4D1E1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNF804BA4D1E1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
ZNF804BA4D1E1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms