Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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