Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX35

IGHV3-64D, Immunoglobulin heavy variable 3-64D, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-64DA0A0J9YX35 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-64DA0A0J9YX35 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-64DA0A0J9YX35 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms