Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
U3KQE9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
U3KQE9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQE9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQE9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQE9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQE9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQE9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQE9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
U3KQE9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
U3KQE9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms