Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms