Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NRXN3Q9Y4C0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms