Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATF5Q9Y2D1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATF5Q9Y2D1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms