Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTNND2Q9UQB3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms