Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CFAP45Q9UL16 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP45Q9UL16 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms