Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RABGEF1Q9UJ41 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RABGEF1Q9UJ41 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RABGEF1Q9UJ41 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RABGEF1Q9UJ41 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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RABGEF1Q9UJ41 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RABGEF1Q9UJ41 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RABGEF1Q9UJ41 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RABGEF1Q9UJ41 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RABGEF1Q9UJ41 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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RABGEF1Q9UJ41 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RABGEF1Q9UJ41 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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