Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CC2D2AQ9P2K1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CC2D2AQ9P2K1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC37.19■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
CC2D2AQ9P2K1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms