Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMCD1Q9NZU5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LMCD1Q9NZU5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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