Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DLL3Q9NYJ7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
DLL3Q9NYJ7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms