Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXC10Q9NYD6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXC10Q9NYD6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms