Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMPD3Q9NY59 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMPD3Q9NY59 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms