Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FZD3Q9NPG1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms