Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACTR3CQ9C0K3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACTR3CQ9C0K3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms