Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NLRP1Q9C000 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NLRP1Q9C000 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms