Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMIM3Q9BZL3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMIM3Q9BZL3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms