Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP1Q9BWH6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP1Q9BWH6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP1Q9BWH6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPAP1Q9BWH6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP1Q9BWH6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP1Q9BWH6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP1Q9BWH6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP1Q9BWH6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP1Q9BWH6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP1Q9BWH6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP1Q9BWH6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP1Q9BWH6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RPAP1Q9BWH6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPAP1Q9BWH6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms