Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TXNDC17Q9BRA2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TXNDC17Q9BRA2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms