Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOXF2Q9BQY4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms