Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIK3R4Q99570 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PIK3R4Q99570 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PIK3R4Q99570 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms