Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RDH12Q96NR8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RDH12Q96NR8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms