Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSNARE1Q96NA8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSNARE1Q96NA8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms