Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TPD52L3Q96J77 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TPD52L3Q96J77 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms