Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR4

ZDHHC12, Probable palmitoyltransferase ZDHHC12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC12Q96GR4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ZDHHC12Q96GR4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ZDHHC12Q96GR4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms