Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
RNF185Q96GF1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms