Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC47Q96A33 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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