Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TRIM63Q969Q1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TRIM63Q969Q1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TRIM63Q969Q1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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TRIM63Q969Q1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TRIM63Q969Q1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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TRIM63Q969Q1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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TRIM63Q969Q1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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TRIM63Q969Q1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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TRIM63Q969Q1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TRIM63Q969Q1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRIM63Q969Q1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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