Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW6

OTOS, Otospiralin, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOSQ8NHW6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OTOSQ8NHW6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OTOSQ8NHW6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms