Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00301Q8NCQ3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00301Q8NCQ3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms