Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPC24Q8NBT2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPC24Q8NBT2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms