Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATG16L2Q8NAA4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATG16L2Q8NAA4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms