Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNLDC1Q8NA58 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms