Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDCL2Q8N4E4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDCL2Q8N4E4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms