Protein–RNA interactions for Protein: Q86U02

LINC00596, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00596, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00596Q86U02 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00596Q86U02 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00596Q86U02 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms