Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NPM2Q86SE8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NPM2Q86SE8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms