Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.72
HECW1Q76N89 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
HECW1Q76N89 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms