Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC149Q6ZUS6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms